Сельскохозяйственный вуз на Смоленщине возник после длительной истории, так как до начала XX века высших учебных заведений на нынешней территории области не было.
Первые шаги в сельскохозяйственной науке сделал А.Н. Энгельгардт. В 1886 г. в родовом имении он создал образцовое хозяйство и школу для подготовки «интеллигентных землевладельцев».
В начале XX века в имении князей Тенишевых в Талашкино была открыта прогрессивная сельскохозяйственная школа, а подготовку кадров для Смоленского региона осуществлял Горецкий сельскохозяйственный институт (ныне Белорусская сельскохозяйственная академия, г. Горки).
Политика советской власти привела к открытию разнообразных высших учебных заведений, включая Комвузы, основанные в 1919 г. В 1932 г. Комвузы были преобразованы в высшие коммунистические сельскохозяйственные школы. В 1933 г. первые 200 выпускников Смоленской областной школы стали специалистами в сельском хозяйстве. Однако в середине 1930-х годов эти школы прекратили свое существование из-за реформирования системы просвещения в стране.
2 декабря 1929 г. бюро Западного обкома ВКП(б) приняло решение об открытии в Смоленске бюджетного сельскохозяйственного вуза. Однако институт, получивший название Зоотехническо-ветеринарного, был открыт только в 1935 г. Для него было построено здание на Октябрьской улице.
Ученые института и опытной станции добились успехов, выведя 11 сортов льна-долгунца, занявших половину сортовых посевов в СССР. Станция была награждена орденом Трудового Красного Знамени.
Институт закрылся во время Великой Отечественной войны и открылся снова в 1952 г. Здание института связано с важными историческими событиями: в 1812 г. здесь прошел военный совет Барклая-де-Толли и Багратиона, в 1917 г. находились Смоленский Совет и ревком, с 1943 по 1954 гг. — городской Совет.
Однако, так и не сделав ни одного выпуска, Смоленский зооветеринарный институт в 1956 г. был переведен в Великие Луки, где продолжили обучение будущие зоотехники, а ветеринарные врачи были направлены в Витебский ветеринарный институт.
В середине 1970-х годов сельскохозяйственное образование на Смоленщине получило новый этап с открытием филиала Московской сельскохозяйственной академии им. К.А. Тимирязева в Смоленске.
Это стало возможным благодаря приказу Министерства сельского хозяйства СССР от 9 августа 1974 г., инициированному Смоленскими областными организациями и первым секретарем Смоленского областного комитета КПСС Иваном Ефимовичем Клименко.
Учебное заведение разместилось в двух зданиях, сыгравших большую роль в исторической, политической, общественной и культурной жизни Смоленска, которые сегодня являются историческими памятниками города.
Филиал начал свою работу 1 декабря 1974 г. с работы подготовительного отделения под руководством кандидата сельскохозяйственных наук Александра Ивановича Головни.
Первыми слушателями стала молодёжь, приехавшая на учебу преимущественно из Смоленской глубинки по направлениям хозяйств, которая составила костяк первого набора, а затем и первого выпуска Смоленского филиала ТСХА.
Александр Иванович Головня сыграл ключевую роль в становлении вуза, создав материально-техническую базу, библиотечный фонд и привлекая профессиональный преподавательский состав.
Экономически отсталое сельскохозяйственное предприятие «Коробово» Вяземского района было передано институту как учебно-опытное хозяйство. Благодаря научно-практической помощи профессорско-преподавательского и студенческого состава, оно было превращено в передовое хозяйство области.
Большинство выпускников продолжают свою профессиональную деятельность на территории Смоленщины, где они оказывают значительное влияние на развитие различных секторов агропромышленного комплекса.